В соответствии со ст. 166 Трудового кодекса Российской Федерации (ТК РФ), служебной командировкой признается поездка работника по распоряжению работодателя на определенный срок для выполнения служебного поручения вне места постоянной работы.

Возможные варианты:
Работник направлен в командировку для работы в выходной день;
Выходные дни приходятся на период служебной командировки;
Выходной день приходится на день отъезда в командировку.

При направлении работника в служебную командировку необходимо руководствоваться нормами Инструкции Минфина СССР, Госкомтруда СССР и ВЦСПС от 07.04.98 г. ≤ 62 "О служебных командировках в пределах СССР" в части, не противоречащей ТК РФ.
Рассмотрим перечисленные варианты.

Вариант 1.
Если работник специально командирован для работы в выходные или праздничные дни.
В соответствии с п.8 Инструкции ≤ 62, компенсация за работу в эти дни производится в соответствии с действующим законодательством, т.е. согласно ст. 153 ТК РФ.
В соответствии со ст. 153 ТК РФ, работа в выходной и нерабочий праздничный день оплачивается не менее чем в двойном размере:
сдельщикам - не менее чем по двойным сдельным расценкам;
работникам, труд которых оплачивается по дневным и часовым ставкам, - в размере не менее двойной дневной или часовой ставки;
работникам, получающим месячный оклад, - в размере не менее одинарной дневной или часовой ставки сверх оклада, если работа в выходной и нерабочий праздничный день производилась в пределах месячной нормы рабочего времени, и в размере не менее двойной часовой или дневной ставки сверх оклада, если работа производилась сверх месячной нормы.
По желанию работника, работавшего в выходной или нерабочий праздничный день, ему может быть предоставлен другой день отдыха.
В этом случае работа в нерабочий праздничный день оплачивается в одинарном размере, а день отдыха оплате не подлежит.

Вариант 2.
Выходные (праздничные) дни приходятся на период служебной командировки.
Работа в служебной командировке производится в организации, в которую направлен работник для выполнения служебного задания.
Эта организация соответственно имеет свой режим работы, закрепленный в правилах внутреннего трудового распорядка. Поскольку работник, направляемый для выполнения служебного поручения именно в другую организацию, не свободен в выборе времени и места выполнения задания, он планирует выполнение работ с учетом режима рабочего времени и времени отдыха организации, в которую он командирован.
Кроме того, в соответствии с заданием на командировку определяются конкретные сроки его выполнения. Командированный работник сам планирует выполнение работ с учетом режима работы, рабочего времени и времени отдыха организации, в которую он командирован.
По мнению специалистов Минтруда России, работа в выходные дни, выполняемая командированными работниками в месте командировки по их инициативе, оплате не подлежит. Это вытекает из самого характера командировки как направления работника для выполнения определенного поручения вне места его постоянной работы, где учет и контроль за ней со стороны администрации затруднены.
Работники, находящиеся в командировке, используют еженедельные дни отдыха в месте командировки, а не по возвращении из нее.
Поэтому другие дни отдыха по возвращении из командировки предоставляться не должны.
В то же время, если работник привлекается к работе в выходные и нерабочие праздничные дни в месте командировки по письменному распоряжению работодателя, эта работа должна компенсироваться в установленном законодательством порядке.
Таким образом, если работа в выходные дни командированному работнику служебным заданием, не предусматривается, то соответственно, компенсация не производится.

Вариант 3.
Выходной день приходится на день отъезда в командировку
Согласно абз.3 п.8 Инструкции ≤ 62 в случаях, когда по распоряжению администрации работник выезжает в командировку в выходной день, ему по возвращении из командировки предоставляется другой день отдыха в установленном порядке.
Если работник не желает воспользоваться другим днем отдыха, ему производится оплата труда как за работу в выходные и нерабочие праздничные дни.
В то же время указанный пункт не урегулировал следующие вопросы:
о предоставлении дней отдыха в случае, если работник по распоряжению администрации возвращается из командировки в выходной день;
в случае, когда оба выходных дня приходятся на время пути к месту командировки;

Из буквального прочтения указанной нормы следует, что у администрации нет обязанности предоставлять работнику отгулы за выходные дни, проведенные в пути, а также в том случае, если выезд из командировки приходится на выходной день.